تمرکز و هدایت منابع در قلمروهاى تحقیقاتی نوظهور و پیشرو از طریق برنامه‌ریزی و تشویق اعضای هیأت‌علمی دانشگاه در جهت ارتقای کیفیت پژوهش، تسهیل هر چه بیشتر فرآیندهای پژوهشی دانشگاه از طریق تدوین و اصلاح دستورالعمل‌ها و شیوه‌نامه‌های پژوهشی دانشگاه، تخصیص اعتبار ویژه، کافی و هدفمند و مدیریت هزینه کرد آن به منظور ارتقاء و بهبود کیفیت خدمات پژوهش از طریق بازنگری شیوه‌نامه‌های اعتبار پژوهشی ویژه اعضای هیأت‌علمی، جذب حمایت مالی از سازمان‌ها و نهادهای حمایتی از اهم اهداف مدیریت پژوهشی و نوآوری دانشگاه است.

هدف اصلی مدیریت پژوهش‌های کاربردی و فناوری، مدیریت و راهبری قراردادهای منعقد‌شده با صنایع و سازمان‌های مختلف است. این دفتر برای برقرای ارتباط بین دانشگاه، صنعت و کشاورزی در مرداد ماه 1370 ایجاد شد. این مدیریت به عنوان کانونی جهت پذیرش نیازهای مراکز صنعتی، خدماتی ـ تخصصی و پژوهشی در قالب پروژه‌های تحقیقاتی ـ پایان‌نامه‌های کارشناسی‌ارشد و دکتری، پروژه‌های تحقیقاتی ملی، انعکاس این نیازها به معاونین پژوهشی و اساتید دانشکده‏‌ها، انجام وظیفه می‌کند.

ارتقای مجموعه آزمایشگاه‌ها و عرصه‌های پژوهشی دانشگاه، تجهیز و توسعه آزمایشگاه مرکزی با تکیه بر کلیه ظرفیت‌های دانشگاه، توسعه همکاری‌های بین‌آزمایشگاهی از طریق ایجاد ارتباط با سایر دانشگاه‌های ملی و بین المللی، ایجاد آزمایشگاه‌های مرجع و همکار با هدف قطبی سازی آنها از طریق توجه به مزیت‌های نسبی دانشگاه و توجه ویژه به موضوع ایمنی، بهداشت و محیط زیست از مهمترین اهداف این مدیریت می‌باشد.